清洗剂决定清洗的深度和感度，深度就是清洗剂的选择和使用方法，感度就是超声波清洗机清洗的效果。
一、尽量多了解清洗剂的物理特性。可以使超声波清洗机的清洗效率大大提高，例如粘度低的清洗剂适用于间隙清洗；沸点低的挥发损失较多，但适用于蒸汽清洗；根据不同清洗剂选择适宜的温度对于清洗效果的影响很大等等。
二、、超声波清洗机的清洗剂可以循环使用。这种清洗方式可以节约大量的清洗剂，每次使用完超声波清洗机后，最好将清洗剂放入容器中，下次使用时再倒入清洗槽，余下的沉淀物可处理掉。如清洗剂的浓度不够时，适量加入一点即可重复使用。
三、废液处理问题。以水系清洗剂为例，由于超声波清洗机在清洗后的废液中含有油脂污垢、泥砂、积炭、金属屑与极性氧化物等，使水质不符合排放标准，应进行处理。一般处理可分三步：
1、用物理方法沉淀静置与过滤，去除悬浮物、浮油和沉渣；
2、破乳化油、盐析、凝聚、气浮与电解相结合，达到油分离；
3、污水净化，可用生物化学法，臭氧法，砂滤活性碳吸附法等。
经过三级工艺处理的废水可达到国家废水排放标准。